ส่วนงานในกำกับของศูนย์การแพทย์ฯ
ตามประกาศมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง เรื่อง การแบ่งส่วนงาน (ฉบับที่ 16) พ.ศ. 2562 ในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 136 ตอนพิเศษ 172 ง หน้าที่ 30 ลงวันที่ 8 กรกฎาคม 2562 ให้ศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง ประกอบไปด้วย
(1) สำนักงานเลขานุการศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง
(2) โรงพยาบาลศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง
(3) ศูนย์บริการสุขภาพแบบครบวงจรแห่งภาคเหนือและอนุภูมิภาคลุ่มแม่น้ำโขง (MFU Wellness Center)
(4) โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงเชียงราย